PCR實(shí)驗(yàn)室屬于三級(jí)生物安全實(shí)驗(yàn)室,其產(chǎn)生的污染源主要有哪些?你了解多少,一起來(lái)看看吧。
PCR實(shí)驗(yàn)室常見(jiàn)污染物有以下五種:(1)臨床樣本中含有大量待測(cè)微生物;(2)通過(guò)科學(xué)研究獲得質(zhì)粒克?。?3)以前分析研究的特定微生物;(4)實(shí)驗(yàn)環(huán)境中含有大量特殊微生物;(5)前期擴(kuò)增產(chǎn)品的殘留污染。
在 PCR實(shí)驗(yàn)室,這也是最容易產(chǎn)生假陽(yáng)性的污染物。通常,一個(gè)典型的 PCR反應(yīng)可以生成10^9個(gè)重復(fù)的序列,這樣一個(gè) PCR反應(yīng)就可以產(chǎn)生10^9個(gè)重復(fù)的序列,在氣溶膠中,即使是最小的氣溶膠,也可以得到10^6的擴(kuò)增產(chǎn)物。如果不加以控制,氣溶膠化反應(yīng)物在短期內(nèi)會(huì)污染實(shí)驗(yàn)室試劑,
儀表與通風(fēng)系統(tǒng)會(huì)造成嚴(yán)重的實(shí)驗(yàn)室污染,并產(chǎn)生大量假陽(yáng)性結(jié)果。RNA擴(kuò)增技術(shù),如 NASBA (NASBA),轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)擴(kuò)增。
不容易產(chǎn)生擴(kuò)增產(chǎn)物(TMA)、 Qbeta復(fù)制酶等,其擴(kuò)增產(chǎn)物為 RNA,在環(huán)境中快速降解。
2.污染預(yù)防措施
(1)嚴(yán)格劃分實(shí)驗(yàn)室,嚴(yán)格遵守
試驗(yàn)室分為試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣品預(yù)制區(qū)、 PCR擴(kuò)增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)等,并配備相應(yīng)的儀器設(shè)備、工作服、手套、取樣裝置和通風(fēng)系統(tǒng)。內(nèi)部區(qū)域
必須直接在各自地區(qū)組裝或包裝使用試劑和廢物。操作者必須小心防止從污染區(qū),包括頭發(fā)、眼睛和衣服等被帶入清潔區(qū)域。
(2)化學(xué)清理
試驗(yàn)臺(tái)面上可用10%次氯酸鈉(漂白劑)清洗,再用70%乙醇或清水洗去次氯酸鈉。次氯酸鈉可以氧化損傷核酸,因此可以停留在試驗(yàn)臺(tái)表面
分散的產(chǎn)物被摧毀。結(jié)果表明,次氯酸鈉對(duì)提取的 DNA和 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物均無(wú)法區(qū)分,而用次氯酸鈉處理的樣品無(wú)法進(jìn)行核酸擴(kuò)增檢測(cè)。實(shí)際上,某些項(xiàng)目的實(shí)際比率
如果需要進(jìn)入反應(yīng)管的圓盤(pán)需要從污染區(qū)轉(zhuǎn)到清潔區(qū),需要用2-10%次氯酸鈉溶液浸泡一夜,然后充分沖洗。
(3)擴(kuò)展產(chǎn)品改性
臨床 PCR檢測(cè)通常包括3~4個(gè)步驟:制備核酸提取和擴(kuò)增檢測(cè)試劑。樣品處理是一種提取目標(biāo)核酸、 PCR擴(kuò)增、產(chǎn)物擴(kuò)增等技術(shù),是一種新的檢測(cè)方法。PCR方法同時(shí)進(jìn)行 PCR擴(kuò)增和擴(kuò)增產(chǎn)物分析。
對(duì)以前的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行適當(dāng)?shù)男揎?,新的擴(kuò)增檢測(cè)應(yīng)該能被排除,但是為了保證擴(kuò)增檢測(cè)不會(huì)影響靶核酸,我們必須遵循兩個(gè)基本原則:
產(chǎn)物經(jīng)修飾后,可與擴(kuò)增反應(yīng)管進(jìn)行修飾,并可與擴(kuò)增反應(yīng)管相區(qū)別,但不影響擴(kuò)增產(chǎn)物序列。
前處理:紫外光照射,酶處理。
修復(fù):補(bǔ)骨脂素、異補(bǔ)骨脂素、鹽酸羥胺、引物水解等。
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